医院承担着存储和治疗重伤士兵的核心功能，其运作机制与常规医疗系统不同。医院并非直接处理绷带类道具，而是专门收容战斗后产生的伤员，分为轻伤和重伤两种状态。轻伤士兵在部队返回主城时会自动恢复，而重伤士兵则必须被安置在医院内部，通过消耗资源和时间逐步恢复战斗力。这种存储机制确保士兵在安全环境中等待治疗，防止他们在战场上永久损失。医院的处理逻辑依赖于玩家对资源分配和建筑管理的策略规划，确保军队能快速重返战场。
医院存储伤兵的能力受容量限制，若重伤士兵数量超过医院容量上限，超出部分将直接死亡。玩家需通过升级医院建筑等级或建造更多医院来扩大总容量，从而有效保存兵力。在和平时期，医院的作用相对有限，但进入战斗阶段后，高等级医院能显著降低因容量不足导致的永久损失。存储策略包括实时监控医院容量，并通过统帅界面查看当前状态，以便在战争频繁时及时调整策略，避免不必要的兵力消耗。、
提升医院治疗能力有助于优化伤兵存储效率，方法包括优先升级医院建筑、研究军事科技中的医疗技术系列以及经济科技中的资源产量类研究。文明选择和建筑风格也会影响治疗速度，例如法国文明可提供治疗加速，而鸢尾之城等风格能叠加增益效果。联盟科技中的部队治疗研究可进一步加成，而国王技能和符文也能提供临时提升，从而加速伤兵的恢复过程。这些因素共同作用，确保医院能高效存储并处理大量伤员。
医院系统通过联盟协作增强存储安全性，玩家可将部队藏入联盟矿或盟友城市，以保护重伤士兵免受敌方攻击。联盟矿内的部队处于无敌状态，而盟友城市则依赖护盾机制提供额外保护。游戏还利用数据加密和权限控制来保护伤兵信息，确保敌方无法直接侦查医院内部数据。这种隐私保护机制与存储策略相结合，帮助玩家在战略层面维护兵力完整性。
