神兵传中分布着多种隐匿的挑战，它们不直接显示在关卡目标里，需要玩家通过特定行为去探索和完成，例如在夜行寻宝关卡中，核心目标是找到藏有正确宝物的宝箱，这些宝箱分布在城镇的院子、擂台和巷子等三个地点，但整个过程中必须避开哨兵的视线，一旦被发现就会直接导致任务失败，因此潜行和观察环境是通关的关键。
隐藏任务与战斗方式或探索细节紧密相关，凶案关卡在进门右转的小路上，玩家可以听到精英怪责骂偷懒守卫的对话，此时击杀这两名偷懒的孙府守卫就能达成一项隐藏目标，而在路见不平关卡里，则需要打碎场景中所有的酒坛才能完成另一项隐藏挑战，这些任务考验玩家对关卡场景的细致观察。
部分隐藏任务需要在特定时间或条件下才能触发，例如在潜入苗疆这一关里就存在一个名为立地成佛的隐藏任务，它需要玩家在夜晚环境下才有机会遇到并接受挑战，完成这类任务通常可以获得独特的武学传承或属性提升等奖励，这要求玩家留意游戏内的环境变化与特殊事件。
面对神兵传中战力较强的杂兵和首领时，完成隐藏挑战往往需要讲究策略，例如优先消灭具有骚扰能力的远程敌人，再逐个击破近战对手，切忌像玩割草游戏一样鲁莽，面对强大的首领时，不贪刀并合理利用精力进行闪避至关重要，同时可以活用飞镖等道具来吸引或削弱敌人，为达成隐藏条件创造机会。还有一些隐藏任务与特定剧情章节或成就挂钩，例如在凤凤章节的梦里看花挑战，其前提是需要先解锁名为感谢的成就，完成这些隐藏成就不仅能推进探索度，还会带来角色成长方面的奖励，玩家在推进神兵传主线时，可以多留意与场景人物的额外互动以及那些看似不寻常的路径。
