首先需要获取药铺建筑这通常需要通过完成特定的游戏剧情或任务来解锁。游戏中存在如保安堂药铺这样的动态建筑，玩家需要通过完成明察暗访辨真伪这一特定剧情来获得，而解锁该剧情需要玩家每日收集由居民提供的线索，并通过侦查来收缴任务物品铅银袋子。
成功获得药铺建筑后玩家便可以开始建造药店，但药店的解锁及后续升级需要准备相应的材料。不同等级的药铺对建材有明确的需求，例如低级升级需要木板、菜肴等基础资源，而更高级别则需要如丝绸、瓷器等更稀有的物资。在低等级阶段，药铺的生产需要安排拥有理财属性的特殊居民进行管理，建筑等级的提升，这一限制会逐步取消。
开设药店并非简单地放置建筑在部分游戏探险玩法中，开启药店功能本身就是一个需要逐步完成的任务流程。典型的任务要求玩家前往药田进行浇水作业，以获取药篮子作为任务道具，随后用一定数量的药篮子去兑换指定的药材，当集齐所需的所有药材后，再找到任务相关的NPC人物如阿珠进行交付，才能最终完成药店的开业准备。
药店建造完毕后合理的布局与经营策略是保证其持续产生收益的关键。玩家的布局思路会受到城市特色与神像加成的影响，例如在杭州府，为了最大化来自便民商栈的双倍收益加成，玩家可以选择在合适的地形上集中建造尽可能多的药铺。而在苏州府，利用白公狸神像对药铺的产量加成进行规划布局，能够显著提升赚钱效率，此时需要综合考虑草药田、炼丹炉与药铺的数量配比以及环境绿化。药店在游戏中的核心功能在于为玩家提供和交换各类药材，这些药材是强化角色、提升实力的重要资源。
