天赋系统是游戏中一个至关重要的永久属性强化模块，它并非针对单个忍者，而是能为玩家所拥有的所有忍者提供全面的属性增益。玩家在游戏主界面的菜单或角色成长相关区域可以找到天赋系统的入口，其界面通常呈现为一个蛇形延伸的天赋树，玩家在此处消耗天赋点和铜币即可激活或升级各个天赋节点，从而稳步提升队伍的整体战斗力。
获得天赋点的唯一常规途径是通关剧情模式中的普通副本。玩家需要达成副本的全部三个挑战条件，以三星评价完成关卡，这样每次通关后就能稳定获得一个天赋点。推进主线剧情并追求三星通关，是积累天赋点、解锁更高级天赋的基础。精英副本不会提供天赋点，其难度更多是用于检验玩家当前由天赋、装备等构成的综合战力。
天赋树结构具有明确的阶级划分，例如一阶、二阶等，玩家需要按顺序逐层解锁。每个天赋节点都提供固定的属性加成，例如攻击、防御、生命值、暴击、命中和闪避等基础属性。这些加成数值会天赋树的深入而逐步提高，将单一阶级内的天赋全部激活后，其提供的总属性加成幅度显著，效果几乎等同于装备带来的提升，是战力构成中不可忽视的一环。
在进行天赋加点时，玩家需要根据自身的战斗风格和需求进行考量。天赋系统允许玩家自由分配天赋点，但需遵循树状结构的解锁路径。虽然理论上可以侧重某一属性，但兼顾攻击、生存等属性的平衡发展，往往能更全面地应对各类战斗场景，避免出现明显的属性短板。每次加点都需要消耗铜币，且越高级的天赋消耗越大，因此合理规划铜币资源与天赋点同样重要。
